金华市市域内江河分属钱塘江、瓯江、曹娥江、椒江3大水系，流域面积分别为9332.73平方千米、949.71平方千米、341.6平方千米和293.96平方千米，分别占全市江河总面积的85.49%、8.69%、3.13%和2.69%。集雨面积在100平方千米以上的江溪有40多条。
矿产资源
金华市境内发现的矿产50余种，可供开发利用的有32种。矿产以非金属居多，其中以萤石储量最为丰富，是国内主要产地之一，总储量在3000万吨以上。其次为石灰岩，储量约为2亿吨。金华九龙--山口岩矿储量0.8亿吨。我市优势矿产有萤石、水泥用灰岩、饰面用花岗石、建筑石料、钾长石、矿泉水、地热水等。
生物资源
金华市在植被分区中属亚热带常绿阔叶林地带。全市森林植物资源有1500余种，其中森林树种440种，草本植物约300余种，农作物品种资源800余种。属国家重点保护野生植物有银杏、金钱松、鹅掌楸、凹叶厚朴、香果树、青檀、浙江楠、半枫荷、花榈木、天竺桂和短穗竹16种。全市森林活立木蓄积量1603万立方米。具有较高经济价值的森林植物有纤维类、淀粉类、糖类、油料类、鞣料类、芳香类、木本药材类等几百种。粮食作物有水稻、麦类、豆类、薯类以及高粱、小米等400余种。经济作物主要有棉花、油料、甘蔗、瓜类、蔬菜、茶叶、水果、蚕桑、药材、花卉及苎麻、席草、莲子、板栗、香榧等共70多类400余种，其中义乌的糖蔗、青枣，武义的西湖蜜梨、宣莲、米仁，兰溪的乌桕、大青豆，浦江的桃形李，金华的佛手、举岩茶，东阳的东白茶、席草，东阳、磐安的药材"浙八味"中的白术、白芍、元胡、元参，永康的五指姜、黄花菜等是地方优质品种。
全市野生动物约有鸟类15目43科153种，哺乳类10目27科65种，两栖类5目14科57种。其中属国家一级保护野生动物有白鹳黑鹳、豹、云豹、白颈长尾雉、黑麂，属二级保护野生动物有穿山甲天鹅、猕猴、鸳鸯、大鲵等。
畜牧业历史悠久，主要畜禽种类有猪、牛、羊、兔、鸡、鸭、鹅及蜂等，金华两头乌和兰溪花猪、永康灰鹅等为地方优质品种。其中主要经济鱼类有青鱼、草鱼、鲢鱼、鳙鱼、鲤鱼、鲫鱼以及长春鳊、三角鲂、团头鲂、鲴鱼、鳜鱼、鳇鱼、泥鳅、黄鳝、鲶鱼等30多种。此外还有甲鱼、河蟹、河蚌、螺等水生动物。